イナズマイレブン
マンモス中学校の雷門中サッカー部のキャプテン円堂守は悩んでいた。 チームはメンバーが足りず廃部寸前。 このままでは公式な試合にも出られない。 ある日、雷門中に生徒がやってくる。 伝説のストライカー、豪炎寺修也だ。 円堂は豪炎寺をチームに誘おうと考える。 この2人の出会いが、弱小サッカー部の運命を変える！！！
マンモス中学校の雷門中サッカー部のキャプテン円堂守は悩んでいた。 チームはメンバーが足りず廃部寸前。 このままでは公式な試合にも出られない。 ある日、雷門中に生徒がやってくる。 伝説のストライカー、豪炎寺修也だ。 円堂は豪炎寺をチームに誘おうと考える。 この2人の出会いが、弱小サッカー部の運命を変える！！！
前作の主人公・円堂守ら率いる日本代表選手「イナズマジャパン」がFFI（フットボール・フロンティア・インターナショナル）世界大会で優勝してから10年後。日本ではサッカーの地位が著しく向上し、中でもイナズマジャパンの中核たる存在「イナズマイレブン」メンバーを数多く輩出した雷門中は、サッカーの名門校として確固たる地位を築き上げた。 サッカーが大好きな少年・松風天馬はそんなイナズマイレブンに憧れ、雷門中学校に入学。さっそくサッカー部に入部しようと意気揚々でグラウンドに向かう。しかし、そこには一人の少年相手に部員たちがボロボロに打ちのめされていた。剣城京介と名乗る少年は、今や全国のサッカーを管理・支配する組織「フィフスセクター」から送り込まれたシード（精鋭選手）だった。 「フィフスセクター」によって勝敗から得点まで全てを管理されてしまったサッカー界で、天馬はあの頃のサッカーを取り戻すため、新たな雷門のイレブンたちと共に立ち上がる。