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かつて新撰組の沖田総司(声 - 小野大輔)の愛刀であった刀剣男士、大和守安定と加州清光を中心に、「とある本丸における刀剣男士たちの花丸な日々」を描く。 舞台となる「とある本丸」における刀剣男士たちの平穏な日常生活を縦軸に、現在の主である審神者とかつての主である沖田総司との狭間で思い悩む「とある本丸」の大和守安定の成長を横軸に、物語は繰り広げられる。